Выделите проект и нажмите tool strip button "Show All Files" в окошке Solution.
Вы увидите все невключенные файлы и папки, лежащие в корне вашего проекта.
Для того, чтобы включить папку или файл в проект вам надо выделить объект и из контекстного меню выбрать "Include in project"
